实验室简介

马属动物研究室

欢迎访问山东省农业科学院奶牛研究中心马属动物研究室网站。我们的研究领域包括但不限于:

  • 家驴基因组组装与注释;
  • 解析马属动物重要经济性状的遗传机制,比如生长相关性状与抗病性状;
  • 家驴的起源与驯化历史。

研究领域

家驴基因组组装

为获得高质量的家驴基因组,我们启动了家驴基因组计划,预期实现两个目标:1)获得组装到染色体水平的家驴基因组参考序列;2)获得高质量的基因组注释结果。

重要经济性状的遗传机制解析

驴全身是宝,驴皮是制作名贵中药“阿胶”的重要原材料,驴肉具有高氨基酸、高不饱和脂肪酸含量的特点,驴奶是组成最接近人奶的动物奶,对这些性状的遗传改良是保证驴产业健康可持续发展的必要前提。骡是马与驴杂交的后代,具有显著的杂种优势,杂种优势的利用将促进马属动物的遗传改良进程。我们开展了多组学层面的研究来解析马属动物重要经济性状及骡杂种优势的遗传机制,旨在对马属动物的遗传改良提供理论指导。

家驴的驯化历史

家驴起源于非洲野驴,其随人类迁徙到欧洲、亚洲、大洋洲、美洲等,在此过程中逐渐被人类驯化,但关于其具体的驯化时间和地点并不清楚。我们从世界多个地域采集了100多头驴的血液样品,通过全基因组重测序技术检测DNA变异,以重构家驴的驯化历史。

数据资源

我们构建了多个数据库已展示我们的研究结果。

转录因子数据库 EquusTFDB

EquusTFDB收录了三个马属物种(马、驴、普氏野马)的转录因子,是目前为止收录转录因子最多的马属动物转录因子数据库,为马属动物基因表达调控网络的比较进化研究提供了重要的数据信息。

家驴基因组信息数据库 DonkeyDB

DonkeyDB是一个提供家驴多组学数据的综合数据库。它可以展示家驴的基因组序列信息,基因注释结果,全基因组水平的DNA变异,多组织的基因表达量信息以及马、驴、骡的全基因组甲基化信息。将为马属动物的基因功能研究提供有力支撑。

出版物

Reconstruction of metabolic network in the bovine mammary gland tissue.

Changfa Wang, Ji Wang, Zhihua Ju, Ruiyan Zhai, Lei Zhou, Qiuling Li, et al.

Molecular Biology Reports 2012, 39(7): 7311-7318.

Role of an SNP in Alternative Splicing of Bovine NCF4 and Mastitis Susceptibility.

Changfa Wang#, Xiuge Wang, Chunhong Yang, Yan Sun, Qiang Jiang, et al.

PLoS One 2015, 10(11): e0143705.

Association between an alternative promoter polymorphism and sperm deformity rate is due to modulation of the expression of KATNAL1 transcripts in Chines Holstein bulls.

Xiaojian Zhang#,Changfa Wang#, Yan Zhang, Zhihua Ju, Chao Qi, Xiuge Wang, et al.

Animal Genetics 2014, 45(5): 641-651.

研究团队

王长法

博士

马属动物研究室主任

Email: [email protected]

王金鹏

博士后,

生物信息学和数量遗传学

Email: [email protected]

孙艳

助理研究员,

动物基因组学和动物育种

Email: [email protected]

杨春红

助理研究员,

动物基因组学和动物育种

Email: [email protected]

合作单位

东阿阿胶股份有限公司

http://www.dongeejiao.com